Stručné shrnutí
Společnost neprokázala část osobních nákladů zahrnutých do odpočtu na podporu výzkumu a vývoje (VaV), a proto neuspěla proti doměření daně. Nejvyšší správní soud potvrdil, že roční průměrná hodinová sazba není sama o sobě zakázána, musí však věrně a kontrolovatelně vyjadřovat skutečné náklady. Současně korigoval dílčí závěr finančních orgánů: zahrnutí náhrad mzdy za dovolenou a svátky do nákladů automaticky nevyžaduje zahrnout dobu této nepřítomnosti do jmenovatele hodinové sazby.
O co šlo
Správce daně neuznal část mzdových nákladů a navazujících režijních nákladů uplatněných v odpočtu VaV za roky 2019 a 2020. Společnost oceňovala práci zaměstnanců ročními průměrnými hodinovými sazbami; evidence navíc obsahovala rozpory s docházkou, mzdovými podklady a průvodkami. V jednotlivých případech vykázané hodiny přesáhly pracovní dobu, dokonce i 32 či 38 hodin za den, práce byla vykázána v den dovolené nebo náklady převýšily superhrubou mzdu zaměstnance. U části záznamů navíc nebylo patrné, jaká konkrétní činnost a zda vůbec činnost VaV byla vykonána. [23] [24]
NSS zdůraznil, že zákon nestanoví jedinou formu oddělené evidence ani jedinou metodu výpočtu osobních nákladů. Zvolený postup ale musí umožnit průkazně zachytit skutečně vynaložené náklady a propojit evidované položky s účetními doklady. Roční průměr proto není nepřípustný jen proto, že je roční; v dané věci byl dalším prvkem neprůkaznosti, protože společnost nedoložila jeho vztah ke skutečným měsíčním nákladům ani možné rozdíly. [28] [30] [32]
Společnost uspěla pouze v dílčí otázce dovolené a svátků. Jestliže se náhrada mzdy zahrne do čitatele hodinové sazby a současně se hodiny dovolené zahrnou do jejího jmenovatele, avšak výsledná sazba se násobí jen skutečně odpracovanými hodinami VaV, část uznatelného nákladu se z odpočtu vytratí. Z pracovněprávní úpravy ani dřívější judikatury takový postup neplyne. NSS však výslovně neoznačil za obecně správný ani alternativní postup společnosti. [37]–[40]
Praktický dopad
Pro odpočet VaV nestačí souhrnný výstup z mzdových listů, ručních výkazů a následných tabulek. Evidence musí umožnit ověřit konkrétní zaměstnance, období, rozsah a obsah činností VaV i vazbu na účetní doklady; zejména musí obstát vůči docházce a mzdám. Používá-li poplatník roční průměr, měl by být schopen jej porovnat s měsíčními skutečnými náklady a vysvětlit odchylky. Neprůkazný mzdový základ může strhnout i režijní náklady vypočtené z tohoto základu. [27] [41] [42]
Zajímavost / podnětná myšlenka
Rozhodnutí prakticky rozlišuje mezi vadnou metodou a neprůkazným výsledkem. Roční průměr není zakázanou technikou, ale bez ověřitelné vazby na skutečné náklady nemusí splnit důkazní standard odpočtu VaV. Dílčí chyba správních orgánů přitom nevede ke zrušení rozhodnutí, pokud nemá vliv na nosný závěr o neprůkaznosti evidence. [30] [41]
Tvrzení soudu
• Odpočet VaV nevyžaduje předepsanou formu evidence, vyžaduje však evidenci hodnověrnou, kontrolovatelnou a propojitelnou s účetními doklady. [28]
• Roční průměrná hodinová sazba obstojí jen tehdy, umožní-li průkazně vyjádřit skutečně vynaložené náklady; zákonná absence výslovného zákazu sama nestačí. [30]
• Více konkrétních rozporů v časových a mzdových podkladech může znevěrohodnit evidenci jako celek, i když jsou některé položky doloženy dodatečnými přehledy. [24] [27]
• Náhrada mzdy za dovolenou může být nákladem VaV; u zaměstnance vykonávajícího i jiné činnosti se uplatní jen v prokázaném poměru. [36]
• Zahrnutí placené nepřítomnosti do jmenovatele hodinové sazby nelze bez dalšího dovodit ze zákoníku práce; výpočet nesmí vyloučit jinak uznatelnou část nákladů z odpočtu. [38]–[40]
• Neobstojí-li neprůkazný mzdový základ, neobstojí ani režijní náklady navázané na tento základ. [42]
Při tvorbě rešerše a komentáře byla částečně využita umělá inteligence. Smyslem rešerše je vystihnout podstatu problému a zjednodušit tak práci s judikáty. Uvedené závěry a tvrzení vyjadřují jen názor provozovatele stránek a nejsou radou ani doporučením jak v obdobných případech postupovat. Před využitím v konkrétních situacích si důkladně zanalyzujte originální text rozhodnutí či si vyžádejte radu profesionála.















